環境管理體系所涉及管理要素包括組織機構、計劃活動、職責、程序、過程和資源等，共分為四大部分、17要素。它與質量、職業健康安全等管理體系密切相融，依然遵循傳統的PDCA（規劃、實施、檢查、改進）模式。
申請環境管理體系認證的文件清單：
1、申請方營業執照復印件/組織機構代碼（適用于無營業執照的事業單位）
2、資質或許可證復印件（法律法規規定需要資質或許可證）
3、有效的管理體系文件（如：管理手冊、程序文件等）
4、產品生產/服務的流程圖□產品類別清單
5、多場所清單（包括不在同一市、縣的部門）
6、產品執行的標準目錄。
7、由具有法定資格的環境監測機構近一年內出具的該組織的各項污染物檢測報告。
8、組織所在地地（市）級（含）以上環境保護行政主管部門出具的該組織在近一年內未因環境違法受到處罰的證明（守法證明）
9、組織地理位置圖及廠區平面示意圖。（圖中包括①標注污染源及監控點位置、消防器材配置點、②污水管網平面圖上需標明流向和對外排污口及受體）
10、廢水、廢氣、噪聲、固體廢棄物等的處理工藝流程圖，主要污染及其污染物，執行的排放標準及類別。
11、新、擴、改項目需提交“環評”“批復”和“三同時”驗收文件。
12、重要環境因素清單、危險化學品清單、法律法規清單及環境管理的目標、指標、管理方案。
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